Parasites and Target lists
Parasites
| Protozoa: | Human/Veterinary | moneywise | candidates |
|---|---|---|---|
| Malaria (P.falciparum, P.vivax) | H | Pf+Pv ordered | |
| Leishmania (L.donovani, L.major, L.infantum) | H/V | Li ordered | |
| Toxoplasma | H/V | Tg 2 remodeler ordered | |
| Trypanosoma brucei | H/V (cattle) | Tb ordered | |
| Trypanosoma cruzi | H | ||
| Cryptosporidium parvum | H/V | Cp ordered | |
| Eimeria spp | V (chicken) | ||
| Babesia spp | V (dogs) | ||
| Theileria spp | V | ||
| Sarcocystis neuronae | V (Horses) |
Targets we should focus on
Sequences links found via BlastP and searching Orthogroups: | ||||
|---|---|---|---|---|
| Protozoa: | Human/Veterinary | Remarks | Single/multiple copy | Snf2-accession |
Malaria (P.falciparum, P.vivax) | H | >$12 billion/year (only Africa) | 1 | https://plasmodb.org/plasmo/app/record/gene/PF3D7_1104200 |
Leishmania (L.donovani, L.major, L.infantum) | H/V | NTD, ~1 million new cases/year | 1 | L.infantum (auch hund): https://tritrypdb.org/tritrypdb/app/record/gene/LINF_330025500 |
| 1 | L.donovani: https://tritrypdb.org/tritrypdb/app/record/gene/LdBPK_331800.1 | |||
| 1 | L.major: https://tritrypdb.org/tritrypdb/app/record/gene/LmjF.33.1700 | |||
| Trypanosoma brucei | H/V (cattle) | ~US$ 4.75 billion per year | 1 | https://tritrypdb.org/tritrypdb/app/record/gene/Tb927.2.1810 |
| Toxoplasma | H/V | ~US$ 7.75 billion per year in US | 2 | [Gene TGME49_273870 (toxodb.org) and https://toxodb.org/toxo/app/record/gene/TGME49_321440](https://toxodb.org/toxo/app/record/gene/TGME49_273870) |
| Cryptosporidium parvum | H/V | very high economic loss, different estimates | 2 | [Gene cgd8_2770 (cryptodb.org) and https://cryptodb.org/cryptodb/app/record/gene/cgd6_3860](https://cryptodb.org/cryptodb/app/record/gene/cgd8_2770) |
| Eimeria spp | V (chicken) | ~3 billion/year | 2 |
which targets to choose: 9-24
Crypto sporidium und Leishmania infantum sind schon bestellt, oder? Das wären meiner Ansicht nach wichtige Parasiten und wir hätten sowohl Zugang zu in vitro also auch in vivo Modellen.
Ansonsten könnte sich noch Eimeria lohnen, da es riesige Probleme in der Geflügelzucht verursacht. Wir haben allerdings nur bedingt ein in vitro System und momentan keinen Tierversuchsantrag dafür. Könnte aber eingeholt werden.
Was Theileria angeht haben wir nur in vitro Möglichkeiten. Sarcocystis neuronae ist meines Wissens "nur" in USA ein Problem.
T.cruzi hat keinen "Markt", aber man könnte über T.brucei nachdenken.
Babesia können wir auch ein in vitro-System aufbauen. Ich würde hierfür aber vorher in der Kleintiertklinik nachfragen, ob es wirklich ein größeres Problem ist...