Leishmania remodeler
https://veupathdb.org
Euglenozoa/Trypanosomatida/Leishmania
Blast with human Snf2H ATPase domain
Leismania blast to hsSnf2H ATPase domain.txt
conclusion: die ATPase domain ist sehr unterschiedlich zur humanen ATPase domain (max49% identity). good target
Align Leismania infantinum (LINF_330025500 / A0A6L0XN27_LEIIN) with PfSnf2L
PfSnf2l ist 300aa länger. aber über das ganze protein sind sie ganz anderst.
Innerhalb Leismania ist Snf2L fast identisch
Leismania infantinum (LINF_330025500 / A0A6L0XN27_LEIIN) und L donovani (LdBPK_331800.1 / A0A3Q8IGW7_LEIDO) remodeler sind bis auf 1 aa L-V (in der Helicase Domäne aa273) gleich
Leishmania infantinum/donovani sind zu 98.3% identisch mit Lmajor (LmjF.33.1700) 5aa unterchiede
wir bestellen nur den Linfantinum klon! LiSnf2Lfl - baculo expression
Is LiSnf2L essential? Probably Yes
Just first feedback: the KO screen has been done in Leishmania mexicana, here is the result:
https://browse.leishgem.org/?q=LmxM.32.1700&selected=LmxM.32.1700 (ortholog of LINF_330025500).
Selection of a full KO failed, indicating essentiality of the gene!!
Structure of LiSnf2L - AlphaFold3
compact structure - few disordered domains
